環境DNAの解析 FAQ

環境DNAの解析
よくあるご質問

Q1.採水時の注意点はありますか?

●容器
ポリ瓶を再利用する場合は10倍希釈した漂白剤(ブリーチ)に3時間以上浸した後、蒸留水でよく流してからお使いください。新品の場合はこの作業は必要ないと考えていますが、慎重を期す場合は行ってください。
●採水
必ず手袋をして採水してください。
●保存
採水後はできる限り早く冷蔵保存してください。冷蔵保存が難しい場合は、下記Q2の「冷蔵保存・送付が難しい場合」を参考にしてください。

 

Q2.サンプル送付時の注意点はありますか?

サンプルが漏れないように蓋をしっかり閉めてください。
必ず冷蔵便で、下記へ送付してください。
※冷凍は推奨しません。凍結融解に伴い細胞が破壊され、解析対象であるDNAが溶液中に放出され、フィルターを通り抜けてしまうためです。

冷蔵保存・送付が難しい場合
「オスバン消毒液」を添加し、常温保存する方法がございます。
2017年4月に発表された下記の論文にて、塩化ベンザルコニウム0.01%添加により10日程度の保存が確認されています。
塩化ベンザルコニウムは「オスバン消毒液」という製品名で10%のものが販売されているので、水1Lに対してオスバンを1ml添加すればよいです。
<参考論文>A simple method for preserving environmental DNA in water samples at ambient temperature by addition of cationic surfactant

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サンプル送付先 ※平日着でお願いします
————————————–
株式会社 生物技研
〒243-0022
神奈川県厚木市酒井3068 天幸第7ビル5階
TEL 046-280-4118
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Q3.見積書作成を依頼する際に必要な情報は何ですか?

<メタバーコーディング解析の場合>
・サンプル数
・解析対象(魚類相、動物相など)
<qPCR解析の場合>
・サンプル数
・解析したい生物名

 

Q4.1つのサンプルで2つの生物種を網羅的解析できますか?

可能です。
<価格例>

・ろ過・DNA抽出
20,000円
・メタバーコーディング解析
20,000円×2=40,000円
  合計
60,000円(税別)

<納期>20営業日

 

Q5.1つのサンプルを網羅的・種特異的の2通りで解析できますか?

可能です。 ※qPCR解析の対象が1生物種で、既にプライマーがある場合
<価格例>

・ろ過・DNA抽出
20,000円
・メタバーコーディング解析
20,000円
・RT-PCR解析
15,000円
  合計
55,000円(税別)

<納期>20営業日

 

Q6.何か事前情報は必要ですか?

メタバーコーディング解析の場合、生息が予想される生物種リストをご連絡いただければ、対象生物がデータベースに入っているかどうかを予め確認できますので、情報があれば送付をお願いします。

 

Q7.どれくらいの量をろ過していますか?

送付いただいたサンプル全量をろ過することを基本としていますが、濁度が高い場合など、フィルターが目詰まりを起こした場合は、その時点でろ過終了となります。複数のフィルターを使用してろ過量を多くしたい場合は、2,500円/フィルター(税別)の追加料金が発生します。

 

Q8.ろ過フィルターはどちらを使うのですか?

2017年9月より0.22μm(PES)のフィルターが内蔵されているろ過ユニット「ステリべクス」の使用を基本としています。濁度が高い場合は状況に応じて0.7μm(GF/F)フィルターを用いた吸引ろ過で行います。

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