FASTQ形式データと品質コード
■ FASTQ形式データ
FASTQ形式は、以下のように4行で1配列(リード)の情報を示しています。
(1行目) @SEQ_ID
(2行目) GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
(3行目) +
(4行目) !''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
1行目: @で必ず始まり、@以降がこの配列の名称を表しています。
2行目: 塩基配列を表しています。
3行目: +で必ず始まります。この行はそれ以外に意味はありません。
4行目: 2行目の塩基の品質を塩基ごとにASCIIコードで表しています。詳細は下をご覧ください。
■ 品質コードについて
4行目のASCIIコード(品質コード)は、以下のような品質スコアと配列正確度を示しております。
※Revioの場合、各範囲の品質スコアは1つのコードに置き換わります(Q40以上は、すべて「I」に置き換わります)。
Revio |
Revio以外 |
品質スコア(Q) |
配列正確度[%] |
Revio
| Revio以外
| 品質スコア(Q) |
配列正確度[%] |
ASCIIコード |
ASCIIコード |
ASCIIコード |
ASCIIコード |
$ |
! |
0 |
0.0000000000 |
I |
P |
47 |
0.9999800474 |
" |
1 |
0.2056717653 |
Q |
48 |
0.9999841511 |
# |
2 |
0.3690426555 |
R |
49 |
0.9999874107 |
$ |
3 |
0.4988127664 |
S |
50 |
0.9999900000 |
% |
4 |
0.6018928294 |
T |
51 |
0.9999920567 |
& |
5 |
0.6837722340 |
U |
52 |
0.9999936904 |
' |
6 |
0.7488113568 |
V |
53 |
0.9999949881 |
+ |
( |
7 |
0.8004737685 |
W |
54 |
0.9999960189 |
) |
8 |
0.8415106808 |
X |
55 |
0.9999968377 |
* |
9 |
0.8741074588 |
Y |
56 |
0.9999974881 |
+ |
10 |
0.9000000000 |
Z |
57 |
0.9999980047 |
, |
11 |
0.9205671765 |
[ |
58 |
0.9999984151 |
- |
12 |
0.9369042656 |
¥ |
59 |
0.9999987411 |
. |
13 |
0.9498812766 |
] |
60 |
0.9999990000 |
2 |
/ |
14 |
0.9601892829 |
^ |
61 |
0.9999992057 |
0 |
15 |
0.9683772234 |
_ |
62 |
0.9999993690 |
1 |
16 |
0.9748811357 |
` |
63 |
0.9999994988 |
2 |
17 |
0.9800473769 |
a |
64 |
0.9999996019 |
3 |
18 |
0.9841510681 |
b |
65 |
0.9999996838 |
4 |
19 |
0.9874107459 |
c |
66 |
0.9999997488 |
7 |
5 |
20 |
0.9900000000 |
d |
67 |
0.9999998005 |
6 |
21 |
0.9920567177 |
e |
68 |
0.9999998415 |
7 |
22 |
0.9936904266 |
f |
69 |
0.9999998741 |
8 |
23 |
0.9949881277 |
g |
70 |
0.9999999000 |
9 |
24 |
0.9960189283 |
h |
71 |
0.9999999206 |
< |
: |
25 |
0.9968377223 |
i |
72 |
0.9999999369 |
; |
26 |
0.9974881136 |
j |
73 |
0.9999999499 |
< |
27 |
0.9980047377 |
k |
74 |
0.9999999602 |
= |
28 |
0.9984151068 |
l |
75 |
0.9999999684 |
> |
29 |
0.9987410746 |
m |
76 |
0.9999999749 |
D |
? |
30 |
0.9990000000 |
n |
77 |
0.9999999800 |
@ |
31 |
0.9992056718 |
o |
78 |
0.9999999842 |
A |
32 |
0.9993690427 |
p |
79 |
0.9999999874 |
B |
33 |
0.9994988128 |
q |
80 |
0.9999999900 |
C |
34 |
0.9996018928 |
r |
81 |
0.9999999921 |
D |
35 |
0.9996837722 |
s |
82 |
0.9999999937 |
E |
36 |
0.9997488114 |
t |
83 |
0.9999999950 |
F |
37 |
0.9998004738 |
u |
84 |
0.9999999960 |
G |
38 |
0.9998415107 |
v |
85 |
0.9999999968 |
H |
39 |
0.9998741075 |
w |
86 |
0.9999999975 |
I |
I |
40 |
0.9999000000 |
x |
87 |
0.9999999980 |
J |
41 |
0.9999205672 |
y |
88 |
0.9999999984 |
K |
42 |
0.9999369043 |
z |
89 |
0.9999999987 |
L |
43 |
0.9999498813 |
{ |
90 |
0.9999999990 |
M |
44 |
0.9999601893 |
| |
91 |
0.9999999992 |
N |
45 |
0.9999683772 |
} |
92 |
0.9999999994 |
O |
46 |
0.9999748811 |
~ |
93 |
0.9999999995 |