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FASTQ形式データと品質コード




■ FASTQ形式データ

FASTQ形式は、以下のように4行で1配列(リード)の情報を示しています。

(1行目) @SEQ_ID
(2行目) GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
(3行目) +
(4行目) !''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65

1行目: @で必ず始まり、@以降がこの配列の名称を表しています。
2行目: 塩基配列を表しています。
3行目: +で必ず始まります。この行はそれ以外に意味はありません。
4行目: 2行目の塩基の品質を塩基ごとにASCIIコードで表しています。詳細は下をご覧ください。


■ 品質コードについて

4行目のASCIIコード(品質コード)は、以下のような品質スコアと配列正確度を示しております。
※Revioの場合、各範囲の品質スコアは1つのコードに置き換わります(Q40以上は、すべて「I」に置き換わります)。

Revio Revio以外 品質スコア(Q) 配列正確度[%] Revio Revio以外 品質スコア(Q) 配列正確度[%]
ASCIIコード ASCIIコード ASCIIコード ASCIIコード
$ ! 0 0.0000000000 I P 47 0.9999800474
" 1 0.2056717653 Q 48 0.9999841511
# 2 0.3690426555 R 49 0.9999874107
$ 3 0.4988127664 S 50 0.9999900000
% 4 0.6018928294 T 51 0.9999920567
& 5 0.6837722340 U 52 0.9999936904
' 6 0.7488113568 V 53 0.9999949881
+ ( 7 0.8004737685 W 54 0.9999960189
) 8 0.8415106808 X 55 0.9999968377
* 9 0.8741074588 Y 56 0.9999974881
+ 10 0.9000000000 Z 57 0.9999980047
, 11 0.9205671765 [ 58 0.9999984151
- 12 0.9369042656 ¥ 59 0.9999987411
. 13 0.9498812766 ] 60 0.9999990000
2 / 14 0.9601892829 ^ 61 0.9999992057
0 15 0.9683772234 _ 62 0.9999993690
1 16 0.9748811357 ` 63 0.9999994988
2 17 0.9800473769 a 64 0.9999996019
3 18 0.9841510681 b 65 0.9999996838
4 19 0.9874107459 c 66 0.9999997488
7 5 20 0.9900000000 d 67 0.9999998005
6 21 0.9920567177 e 68 0.9999998415
7 22 0.9936904266 f 69 0.9999998741
8 23 0.9949881277 g 70 0.9999999000
9 24 0.9960189283 h 71 0.9999999206
< : 25 0.9968377223 i 72 0.9999999369
; 26 0.9974881136 j 73 0.9999999499
< 27 0.9980047377 k 74 0.9999999602
= 28 0.9984151068 l 75 0.9999999684
> 29 0.9987410746 m 76 0.9999999749
D ? 30 0.9990000000 n 77 0.9999999800
@ 31 0.9992056718 o 78 0.9999999842
A 32 0.9993690427 p 79 0.9999999874
B 33 0.9994988128 q 80 0.9999999900
C 34 0.9996018928 r 81 0.9999999921
D 35 0.9996837722 s 82 0.9999999937
E 36 0.9997488114 t 83 0.9999999950
F 37 0.9998004738 u 84 0.9999999960
G 38 0.9998415107 v 85 0.9999999968
H 39 0.9998741075 w 86 0.9999999975
I I 40 0.9999000000 x 87 0.9999999980
J 41 0.9999205672 y 88 0.9999999984
K 42 0.9999369043 z 89 0.9999999987
L 43 0.9999498813 { 90 0.9999999990
M 44 0.9999601893 | 91 0.9999999992
N 45 0.9999683772 } 92 0.9999999994
O 46 0.9999748811 ~ 93 0.9999999995