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納品データにつきまして


納品させていただきました解析結果のデータについて、ご説明致します。

■ Raw_data フォルダ
Raw_bam/Sample.bam
:raw bam(HiFi bam)ファイルです。
Raw_bam/Sample.bam.pbi
:Sample.bamのindexファイルです。
Raw_fastq/Sample.fastq.gz (※)
:品質値付き塩基配列となります(HiFiリード)。詳細はこちらをご覧ください。
Raw_fastq/experiment.tsv
:サンプル調製方法およびラン条件に関する情報です。
  DDBJ-DRAへのデータ登録時、「Experiment」への入力に必須な情報です。
Raw_fastq/md5sum.tsv
:DDBJ-DRAへのデータ登録時、「Run」への入力に必須な情報です。
  md5値はDDBJへデータ送信時にファイルが破損しているかどうかを確認するために必要な値です。
※DDBJ-DRAへのデータ登録を前提として、ファイルを圧縮(gz形式)しております。
   解凍する場合は、以下の無償ソフト等にて解凍が可能でございます。

Lhaplus (ご所属機関にご確認の上、ご利用ください。)
http://www.vector.co.jp/soft/win95/util/se169348.html

DDBJ-DRAへの登録については、下記の弊社サイトをご参考にしていただければ幸いです。
http://gikenbio.com/dnaanalysis/ngs/ddbj/

■ Clustering
Sample.clustered.cluster_report.csv
:クラスタリングの結果一覧表です。
Sample.clustered.hq.fasta.gz
:予測正確性99.0%以上の転写産物の配列です。
Sample.clustered.lq.fasta.gz
:予測正確性99.0%以下の転写産物の配列です。


株式会社 生物技研
Tel:042-780-8333 Fax:042-780-8334
E-mail:dna@gikenbio.com