ゲノム解析・ショットガンメタゲノム解析

ゲノム解析
ショットガンメタゲノム解析

1. サービス概要

価格とデータ量 ゲノム解析 バクテリアとアーキア 1Gb 40,000円/サンプル(税別)
ゲノムサイズ100Mbまで 5Gb 50,000円/サンプル(税別)
ゲノムサイズ1Gbまで 50Gb 180,000円/サンプル(税別)
ショットガンメタゲノム解析 5Gb 50,000円/サンプル(税別)
納期 4~6週間
作業内容 ・送付サンプルのDNA濃度測定(蛍光法による2本鎖DNAの定量)
・シーケンスライブラリー作製
・シーケンシング解析(DNBSEQ-G400 150bpペアエンド解析)
ご提供
サンプル
抽出ゲノムDNA(>10ng/ul、>20ul)
※濃度は、蛍光法を用いた2本鎖DNAの定量結果を基準としています。
● 260nmの吸光度ベースで定量されている場合
上記より高めの濃度(可能であれば、 >100ng/ul)で送っていただく必要があります。DNAの質は一般的な260/280が1.8以上が望ましいです。
ご提供情報 1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください
2.オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください

 

2. オプション

項目 備考 価格(税別) 追加
納期
DNA抽出 試料を送付いただき、弊社でDNA抽出を行います。 10,000円/サンプル 1週間

ータ解析
バクテリア
およびアーキア向け
アセンブル(オートアノテーション含む) オートアノテーションは、prokka(ソフトウェア)を使用して得られた予測遺伝子配列とタンパク質配列、遺伝子の位置情報(gff形式データ)をご提供します。 30,000円 1週間
マニュアルアノテーション オートアノテーションから得られた予測遺伝子をKEGGやGOデータベースに登録されている配列と比較することで、得られた予測遺伝子にKEGG_IDやGO_IDを対応させます。 100,000円 1週間
真核生物向け アセンブル 価格と納期はゲノムサイズによって変わります。 ゲノムサイズ100Mb未満 50,000円 1週間
ゲノムサイズ1Gb未満 100,000円 2週間
ゲノムサイズ1Gb以上 要相談 要相談
Exonerateを用いたEvidence-baseの遺伝子予測 遺伝子モデルに使用する遺伝子配列を送付いただく必要があります。 50,000円 1週間
RNA-seqを用いた遺伝子予測 サンプル送付時にトータルRNAも送付いただく必要があります。 100,000円 1週間
マッピングとORFの変異点解析 参照配列に遺伝子アノテーションがある必要があります。 5サンプルまで一律100,000円
※6サンプル以上の場合、1サンプルあたり+10,000円
1週間
ナノポア社のGridION X5 を使用したシーケンス解析 ちらしを別途ご用意しています。
ヒラメを解析した参考事例も掲載していますので、ぜひご覧ください。
100,000円~ 0日~
ハイブリッドアセンブル

 

3. よくある質問

DNBSEQについてのよくあるご質問はこちらをご覧ください

 

4. ちらしPDF

dnbseqちらし DNBSEQを用いたゲノム解析・ショットガンメタゲノム解析のパンフレットPDF

 

4. お問合せ・サンプル送付先

●お問合せ・お見積り依頼

お問合せフォーム、メール(dna@gikenbio.com)、または お電話(042-780-8333)でお気軽にご相談ください。

●サンプル送付先

移転のため、送付先が変更になりました。ご注意ください。
株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

<添付書類>
サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください。
オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください

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