Oxford Nanopore Technologies社の
GridION X5 を用いたゲノム解析

GridION X5はロングリードを取得できるシーケンサーです。

1-1.GridION X5 ゲノム解析パッケージプラン

価格（税別）	バクテリア	100,000円/サンプル
	ゲノムサイズ100Mb未満	225,000円/サンプル
	ゲノムサイズ100Mb以上	要相談
納期	4～6週間　※ゲノムサイズ100Mb以上の場合は要相談
作業内容	・送付DNAの品質確認 ・シーケンスライブラリー作製 ・シーケンシング解析（GridION X5）
ご提供サンプルと情報	ご提供いただくDNAの量と質がとても大事です。 以下「2.ご提供いただくサンプルと情報について」をご覧ください。

1-2.GridION X5 フローセル占有プラン

価格（税別）	ライブラリー調製	25,000円/サンプル
	シーケンシング解析	200,000円/フローセル
納期	4～6週間
備考	データ量の目安：5-10Gb/フローセル ※データ量は、抽出DNAの品質に依存します。弊社チャンピオンデータは、21.3Gb(Passed Bases）です。 最長リード長：200kb
ご提供サンプルと情報	ご提供いただくDNAの量と質がとても大事です。 以下「2.ご提供いただくサンプルと情報について」をご覧ください。

2.ご提供いただくサンプルと情報について

ご提供 サンプル	抽出ゲノムDNA 1.DNA量 バクテリア または ゲノムサイズ100Mb未満の解析の場合で、濃度50 ng/ul以上、液量 100ul 以上 が理想です。 最低でもDNA量は 2ugが必要です。 2.DNAの品質 260/230 と 260/280 は 1.5以上、電気泳動で20kbあたりにバンドが見えていることが望ましいです。
	DNA抽出からご依頼いただくことも可能です。 弊社では、GridIONゲノム解析用のサンプルについては、Genomic-tip（Qiagen）を用いて、DNA抽出を行います。 DNA抽出料金は30,000円/サンプル（税別）で、納期は1週間追加となります。 ご提供いただくサンプル量の目安は、細胞数 1×10^9 ～ 5×10^9程度、湿重量 20～100 mg程度です。
ご提供情報	1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください 2.オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください

3. よくある質問

GridIONを用いた解析における塩基配列の読み取り精度はどれくらい？

Oxford Nanopore Technologies社の継続的な技術開発によって、解析の性能が常に向上しています。下図は、Nanopore 16S Barcoding Kitを使用してシーケンスデータを取得後、品質の良い5万配列をNCBI 16S Microbial Databaseに対してBLAST検索を行った結果です。ヒットした配列に対する配列一致率の平均値は94.2%から97.0%にアップしました。

4. ちらしPDF

　GridIONを用いたゲノム解析・ハイブリッドアセンブルのちらしPDF

5. お問合せ・サンプル送付先

●お見積り依頼

お見積りフォームがございます。
・ゲノム解析お見積りフォーム（ロングリード・ハイブリッドアセンブル専用）

●お問合せ

お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または　お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。

●サンプル送付先

移転のため、送付先が変更になりました。ご注意ください。
株式会社生物技研
〒252-0154　神奈川県相模原市緑区長竹657　/　TEL　042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

＜添付書類＞
・サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください。
・オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください