サービス内容
ロングリードゲノム解析には以下のデータ量を推奨しています。
ゲノムアセンブル解析：ゲノムサイズの20倍以上
メタゲノム解析：6 Gb以上
ライブラリー調製方法には標準ライブラリの調製の他に、PCRを使用しない方法とインプットDNA量が少ない場合の調製方法もあります。それぞれの特徴について示します。
| メリット | デメリット | |
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PCR-free |
PCRバイアスを避けてシーケンシングができ、精度の高い解析が可能 | 必要なDNA量が多い（濃度50 ng/μL以上、総量4 µg以上） |
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PCRあり |
必要なDNA量が少ない（濃度5 ng/μL以上、総量200 ng以上） | PCR増幅を行うため、PCRバイアスが生じる可能性がある |
可能ですが、出力データ量は均等にならない場合があります。そのため、データ量に余裕を持ってプランを検討いただくことをおすすめします。
お受けしておりません。
得られる塩基の正確性が圧倒的に違います。
PacBio Revioを用いたシーケンシング解析で取得できる「HiFiリード」はイルミナ社のショートリード以上の正確性なので、ナノポア社のリードと異なり、ロングリードのみでアセンブルができます。
PCR-freeの場合のみご提供可能です。追加費用は、2万円/サンプルとなります。
核酸抽出のみのご依頼はお受けしておりません。
はい。作業内容の詳細は作業報告書をご確認ください。
料金
10万円/サンプル（原核生物で8サンプル以上）～。最新の料金やオプションはサービスページを参照ください。
https://gikenbio.com/dnaanalysis/ngs/genome/pacbio/
見積書のご依頼は、見積依頼フォームへご入力ください。
https://gikenbio.com/quotations/
サンプル送付
PCR増幅ありの場合は、濃度5 ng/μL以上、総量 200 ng以上です。
PCRフリーの場合は、濃度50 ng/μL以上、総量 4000 ng以上です。
その他品質等の詳細は各ページまたはパンフレット（ちらし）をご確認ください。
データ解析
極端なGCリッチ/ATリッチの配列、PacBioのHiFiリードよりも長い反復配列の存在が考えられます。また、PCRありで解析している場合、PCRバイアスが影響を与えることもあります。
可能ですが推奨はしません。Pacbioのロングリードは、ショートリードで補完する必要はなく、ロングリードのみを使用した解析が推奨されます。
可能です。追加費用1万円/サンプルです。
データベースへの登録代行はお受けしておりません。
メール・電話・WEBミーティングのいずれでも対応可能ですので、お気軽にご連絡ください。