サービス内容
下記に比較表をご用意しました。
| RAD-seq解析 | GRAS-Di®解析 | MIG-seq解析 | |
| ライブラリー作製様式 | 制限酵素 | PCR | |
| 塩基解読する領域 | 制限酵素部位の間 | ランダム | 単純反復配列(SSR)の間 |
| 得られる多型の数 | 多い（-100,000 SNPs） | 少ない（-1,000 SNPs) | |
| 適した解析名 | 遺伝子地図作成やqtl解析、集団解析 | 集団解析 | |
| 必要DNA量 | 多い（100ng以上） | 少ない（15ng） | 少ない（2-100ng） |
| DNAの品質 | 高品質のDNA量が必要 | 低品質のDNAでも可 | |
| 費用 | 高い | 安い | |
RAD-seq:
制限酵素サイトの間を増幅することが可能です。制限酵素を使用することから、高品質でDNA量も必要になります。
GRAS-Di:
トヨタ自動車様が開発された手法で、プライマーを高濃度で添加してPCRすることでゲノム上のランダムな領域を増幅することが可能です。DNA濃度が15 ng/ul必要ですが、再現性が高いです。
MIG-seq:
東北大の陶山先生が開発された手法で、SSRの間の領域を増幅することが可能です。劣化したようなDNAでも解析が可能です。
下図は、これら手法のイメージ図です。
はい。fastq形式の配列データを納品しています。
はい、ご用意しています。「3.解析参考例」をご覧ください。
状況によってお受けできる場合もございますのでご相談ください。
はい。作業内容の詳細は作業報告書からご確認いただけます。
料金
GRAS-Di🄬解析：32.2万円/48サンプル（抽出DNA送付、GRAS-Di🄬解析ソフトによる解析の場合）～。
MIG-seq解析：32.2万円/48サンプル（抽出DNA送付、ジェノタイピング+系統解析の場合）～。
RAD-seq解析：47.2万円/48サンプル（抽出DNA送付、ジェノタイピング+系統解析の場合）～。
その他のサンプル数の場合や、最新の料金やオプションはサービスページを参照ください。
https://gikenbio.com/dnaanalysis/ngs/radseq/
見積書のご依頼は、見積依頼フォームへご入力ください。
https://gikenbio.com/quotations/
サンプル調製
特にございませんが、市販のDNA抽出キットの使用を推奨しています。
サンプル送付
サービスプランによります。各ページまたはパンフレット（ちらし）をご確認ください。