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nanoporeテスト結果

oxfordnanoporeのMinIONのテスト結果です。

1ヶ月くらい前に結果は出ていたのですが、あまり良い結果ではなく次の一手がなかなか見いだせない状況であったので業務多忙により放置しておりました。

最近学会等でMinIONの事を聞かれるので結果を公開することにしました。

MinIONはハードウエア(試薬も)/ソフトウェアも常にアップデートを繰り返しているので、我々の結果は現在の最新スペックとは少し異なります。

ライブラリー調製やフローセルへのサンプルアプライはプロトコルには書かれていないコツみたいなものが必要なようです。

塩基の読み取り精度はイルミナのシーケンサーと比較するとまだまだなようです。

16Sの全長解析では欠損が結構あったようです。

naopore_test-1bacteria genome

nanopore_test-2 16s full

 

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