環境DNA解析 遺伝的多様性解析
同じ生物種で遺伝的に異なる（遺伝的多様性がある）集団が、日本各地に存在します。しかし、形態が同じため、外見では判断できず、これまで解析が困難でした。
生物技研では、次世代シーケンサーを用いた環境DNA解析により、ハプロタイプを検出します。
1. 環境DNA 遺伝的多様性解析の価格と納期
| 価格 | 42,000円/サンプル(税別） ※上記は、弊社で水サンプルのろ過から行う場合の料金です。 抽出DNAを送付いただく場合は、-7,000円/サンプル、ろ過済フィルターを送付いただく場合は、-4,000円/サンプルです。 |
|
|---|---|---|
| 納期 | 20営業日 プライマーの設計・合成が必要な場合は、プライマー合成完了後20営業日です。 |
|
| 解析系がある生物種 | イワナ、コイ 上記以外の生物種についてはご相談ください。プライマー設計・合成費は無償です。 |
|
| オプション | 解析の反復 | より正確なデータを得るため、標準の4反復（1stPCRを4反復、2ndPCRで1反復/反復）から反復を増やすオプションです。 8反復 +15,000円/サンプル 1stPCRを4反復、2ndPCRで2反復/反復（計8反復） 16反復 +35,000円/サンプル 1stPCRを4反復、2ndPCRで4反復/反復（計16反復） |
| データ解析 | ハプロタイプネットワーク解析 30,000円 検出されたハプロタイプのネットワーク図を作成します。 |
|
| 納品物 | 以下のデータをダウンロード形式で納品します。 ・報告書 ・シーケンス生データ（fastq形式） ・データ解析結果（エクセルファイル） ・DDBJのデータベース登録に必要なデータ |
|
2. 環境DNA 遺伝的多様性解析の流れ
 （お客様） サンプルの送付 |
水サンプル(>1L)を冷蔵便で送付下さい。
冷蔵保管と発送が難しい場合は下記を参考にしてください。 |
|
| ↓ | ||
| ろ過 | フィルターを用いて、ろ過を行います（弊社標準フィルターは、ステリべクス-GP 0.22μmです。水の濁度が高いなど、標準フィルターだけではろ過が難しい場合は、プレフィルターも用いてろ過を行います）。 | |
| ↓ | ||
| DNA抽出（注1） | フィルターに捕集された物質からDNAを抽出します。抽出DNAからPCR阻害物質を除去した後、DNA濃度を測定します。 | |
| ↓ | ||
| メタバーコーディング解析 | ライブラリー作製 | 遺伝子 (cytBやD-loopなど) 領域をターゲットとして、ライブラリーを複数反復分作製します。その後、ライブラリーの濃度と品質を確認致します。 |
| ↓ | ||
| シーケンス解析 | Illumina NextSeq1000、MiSeq i100 Plus またはMiSeqを使用してシーケンシング解析を行います。2x300bpのpaired-endリードを取得します。 | |
| ↓ | ||
| データ解析 | DADA2法を用いて、得られた塩基配列を100％の条件でまとめます。その後、配列情報が登録されている場合は、配列比較した結果を納品致します。 | |
注1）抽出されたDNAは、メタバーコーディング解析や リアルタイムPCR解析にも使用することが可能です(追加料金が必要です)。
3. 環境DNA 遺伝的多様性解析の具体例
イワナの遺伝的多様性解析
（滋賀県水産試験場の亀甲博士と菅原博士との共同研究）
4.パンフレット
5. お問合せ・お見積り依頼
●お問合せ・お見積り依頼
お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。
●サンプル送付先
株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。
