環境DNA 種特異的解析（リアルタイムPCR解析）

種特異的環境DNA 種特異的解析（リアルタイムPCR解析）

リアルタイムPCRを用いた解析です。環境中のDNAを種特異的なプライマーセットでPCR増幅しながら、特定生物の在・不在を解析します。
プライマーの設計・合成から承っています。

1. 環境DNA 種特異的解析（リアルタイムPCR解析）

価格 解析 20,000円/サンプル（税別）
＜内訳＞
・ろ過　4,000円/サンプル
・DNA抽出　6,000円/サンプル
・リアルタイムPCR解析　10,000円/サンプル
プライマーの設計・合成 100,000円（税別）
対象の生物種やその近縁種、生息する生物種などの情報をご連絡下さい。プライマーやプローブは、in silicoで設計するため、対象の生物種のみを検出できる保証はできません。対象生物や近縁種の個体やDNAをお送り頂ければ、特異性の検証を行うことも可能です。

★既に設計･合成済のもの（下記）は料金不要です。
ブルーギル、オオクチバス、アユ、オオサンショウウオ、ハクバサンショウウオ、ニホンウナギ、イワナ、ヤマメ、ニホンザリガニ、ウチダザリガニ、など
納期 6営業日
※プライマーの設計・合成が必要な場合は、プライマー合成完了後10営業日です。
納品物 以下のデータをダウンロード形式で納品します。
・報告書
・解析データ（※データを確認するには専用のソフトウェアが必要です。ソフトウェアは無料です。）
オプション 定量解析
（DNAコピー数の算出）		 2サンプルまで：+10,000円/サンプル（税別）
3～20サンプル：＋30,000円/依頼・生物種（税別）
解析の反復 8反復： +6,000円/サンプル（税別）
より正確なデータを得るため、リアルタイムPCRを標準の4反復から８反復へ増やすオプションです。

環境DNA用ポータブルチューブポンプ貸出

2. 環境DNAを用いた種特異的解析の流れ


（お客様）
サンプルの送付		 水サンプル(1 L)を冷蔵便で送付下さい。
必ず「サンプル情報提供用紙」を同封してください。

冷蔵保管と発送が難しい場合は下記を参考にしてください。
環境DNA解析用の水サンプルの保管と発送方法について
↓
ろ過 フィルターを用いて、ろ過を行います（弊社標準フィルターは、ステリべクス-GP 0.22 μmです。水の濁度が高いなど、標準フィルターだけではろ過が難しい場合は、プレフィルターも用いてろ過を行います）。
↓
DNA抽出（注1） フィルターに捕集された物質からDNAを抽出します。抽出DNAからPCR阻害物質を除去した後、DNA濃度を測定します。
↓
リアルタイムPCR解析 LightCycler 96システム（Roche）等を使用して解析を行います。
同時に別の生物種も解析することが可能です(追加料金: 20,000円/サンプル・生物種)。

注1）抽出されたDNAは、リアルタイムPCR解析だけでなく メタバーコーディング解析にも使用することが可能です(追加料金: 20,000円/サンプル)。

3. 環境DNAを用いた種特異的解析の具体例

群馬県と神奈川県におけるブルーギルとオオクチバスの在/不在

解析例
上段がブルーギル、下段がオオクチバスの結果で、分母が反復数、分子が検出回数を示しています。ブルーギルはTakahara et al.,2013、オオクチバスはYamanaka et al., 2016の方法を参照し、解析を行いました。

●使用機器
LightCycler　蛍光強度グラフ
LightCycler 96システム（Roche）等を使用し、上記のようなデータで在・不在を判断します。

4. パンフレット

eDNAパンフレット環境DNA解析のパンフレットPDF

5. お問合せ・お見積り依頼

●お問合せ・お見積り依頼

お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。

●サンプル送付先

2019年6月10に移転しました。送付先が変更になっていますので、ご注意ください。
株式会社生物技研
〒252-0154　神奈川県相模原市緑区長竹657　/　TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

＜添付書類＞
・サンプル情報提供用紙（環境DNA用）→サンプル送付時に同封ください