miRNA-seq解析サービス

2021年11月サービス開始しました!

1.miRNA-seq解析サービス

価格(税別) 8サンプル以上~
60,000円/サンプル
※8サンプル未満の場合、サンプル数に限らず480,000円のご対応となります。
納期 30営業日
データ量 3,000万リード
作業内容 ・送付サンプル(トータルRNA)の品質確認(注1)
・シーケンスライブラリー作製(MGIEasy Small RNA Library Prep Kit 使用)
・シーケンシング解析(DNBSEQ-G400 50bpシングルリード解析)
・データ解析
アダプター配列を除いた後、配列長の分布図を作成します。
取得された配列と正規化したリード数を算出します。
Bowtieソフトウェアを用いて参照配列に取得された配列をマッピングします。
納品物 以下のデータをDVDやUSB等の記録媒体に保存して納品します。
・報告書
・シーケンス生データ(fastq形式)
・マッピングとカウント結果(エクセルファイル)
・参照配列(fasta形式)と遺伝子アノテーション(gff形式)
・DDBJのデータベース登録に必要なデータ
ご提供サンプル トータルRNA 1 μg以上(>50ng/ul、>20ul)
※滅菌水に溶解した状態で冷凍便を使用して送付ください。
ご提供情報 1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください
2.オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
3. データ解析依頼書→ 〃
レファレンス配列(fasta形式)/遺伝子アノテーション情報(gff形式, gtf形式)はCD-RやUSBに入れて送付頂くか、ダウンロードできるURLをご連絡下さい。

(注1)rRNAの分解が進んでおり、シーケンシング解析を行ってもデータが得られないと判断した場合は、中止させていただきます(この場合のご請求は行いません)。

2.よくある質問

Q1.miRNAseq解析用のRNA抽出に推奨のキットは?

miRNeasy(QIAGEN) や ReliaPrep miRNA Cell and Tissue Miniprep System(Promega)がおすすめです。

Q2.送付の際、バッファーは何でもよい?

滅菌水のほか、Tris や TE 、抽出キットの溶出バッファーでも構いません。但し、塩濃度が高いバッファーの場合、QCの電気泳動がうまくいかない可能性がありますので、避けてください。

Q3.RIN値など品質の目安は?

バイオアナライザーのRIN値で7.5以上、A260/280は1.8-2.0が目安です。送付前にお客様側でも品質確認される際は、参考にしてください。

Q4.DNase処理は必要?

ゲノムDNAの混入は望ましくないので、DNase処理をお勧めします。

Q5.送付時の温度帯は?

●total RNA送付
冷凍便を利用し、必ずドライアイスを同梱してください。

 

3.ちらしPDF

RNA-seq DNBSEQを用いたRNA-seq解析のパンフレットPDF

4.お問合せ・サンプル送付先

お見積り・お問合せ

お見積りフォームお問合せフォーム、メール(dna@gikenbio.com)、または お電話(042-780-8333)でお気軽にご相談ください。

サンプル送付先

株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

<添付書類>
サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください。
オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
データ解析依頼書→ 〃

 

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