1. メタトランスクリプトーム解析サービス概要
| 価格 | 65,000円/サンプル（税別） |
|---|---|
| データ量 | 3,000万リード/6Gb |
| 納期 | 25営業日 |
| 作業内容 | ・送付サンプル（トータルRNA）の品質確認 ・原核生物のrRNA除去 ・シーケンスライブラリー作製 ・シーケンシング解析（DNBSEQ-G400 200bpペアエンド解析） |
| 納品物 | 以下のデータをDVDやUSB等の記録媒体に保存して納品します。 ・報告書 ・シーケンス生データ（fastq形式） ・DDBJのデータベース登録に必要なデータ ※データ量が多い場合はHDD納品となり、HDD代として別途10,000円（税別）がかかります。お手持ちのHDDを送付いただき、そちらに保存して納品することも可能です。 ＜HDD納品となる目安＞生データ納品の場合は200Gb、データ解析ありの場合は100Gb |
| ご提供サンプル | トータルRNA1μg以上 ( >50 ng/ul、 >20 ul） ※滅菌水に溶解した状態で冷凍便を使用して送付ください。 ※1 μg以上のトータルRNAがご用意できない場合は、ご相談ください。 |
| データ解析（オプション） | 特定生物由来のリードの除去 50,000円（税別） ※8サンプルまでの固定価格/9サンプル以降は追加料金6,250円/1サンプル 納期：＋2営業日 ※9-20サンプルは3営業日,21-40サンプルは4営業日、41サンプル以上は要相談 |
| アセンブル・マッピング 100,000円（税別） ※8サンプルまでの固定価格/9サンプル以降は追加料金12,500円/1サンプル 納期：＋2週間 ※9-20サンプルは3週間,21-40サンプルは4週間、41サンプル以上は要相談 |
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| アセンブル・マッピング・遺伝子予測・機能解析 200,000円（税別） ※8サンプルまでの固定価格/9サンプル以降は追加料金25,000円/1サンプル 納期：＋4週間 ※9-20サンプルは6週間、21-40サンプルは8週間、41サンプル以上は要相談 |
データ解析（オプション）の説明
生リードから低品質塩基の除去を行った後、アセンブルを行い、コンティグ(配列断片)を取得します。得られた配列断片に対し、高品質のリードをマッピングし、各配列断片とマップされたリード数の対応表を作成します。
さらに遺伝子予測・機能解析では、配列断片から細菌の遺伝子を予測します。その後、予測された遺伝子配列はKEGGデータベースの配列と比較し、機能的な注釈を付加します。
〔アセンブル・マッピング・遺伝子予測・機能解析〕納品データのサンプル
2.DNBSEQについてよくある質問
Q1.特徴は？
なんといってもコストパフォーマンスがよいことです。低価格で高品質のショートリードが取得できます。
Q2.出力データはどんな形式？
出力はfastqファイルで、Q値は最新のイルミナ社製シーケンサーと同様にsanger形式です。
Q3.生データのクオリティは？
DNBSEQ-G400(MGI社）とHiSeq（イルミナ社）を用いてシーケンシング解析を行い、取得したリードのQ20およびQ30を比較したところ、2機種のそれらは同等でした。
3.ちらしPDF
DNBSEQを用いたメタトランスクリプトーム解析のパンフレットPDF
4. お問合せ・サンプル送付先
お問合せ・お見積り依頼
お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。
サンプル送付先
株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。
＜添付書類＞
・依頼書→dna@gikenbio.comへ送信ください。あわせてサンプル送付時に印刷したものを同封ください。
