メタトランスクリプトーム解析

1. メタトランスクリプトーム解析サービス概要

価格	65,000円/サンプル（税別）
データ量	3,000万リード/6Gb
納期	25営業日
作業内容	・送付サンプル（トータルRNA）の品質確認 ・原核生物のrRNA除去 ・シーケンスライブラリー作製 ・シーケンシング解析（DNBSEQ-G400 200bpペアエンド解析）
納品物	以下のデータをDVDやUSB等の記録媒体に保存して納品します。 ・報告書 ・シーケンス生データ（fastq形式） ・DDBJのデータベース登録に必要なデータ ※データ量が多い場合はHDD納品となり、HDD代として別途10,000円（税別）がかかります。お手持ちのHDDを送付いただき、そちらに保存して納品することも可能です。 ＜HDD納品となる目安＞生データ納品の場合は200Gb、データ解析ありの場合は100Gb
ご提供サンプル	トータルRNA1μg以上 ( >50 ng/ul、 >20 ul） ※滅菌水に溶解した状態で冷凍便を使用して送付ください。 ※1 μg以上のトータルRNAがご用意できない場合は、ご相談ください。
ご提供情報	・サンプル情報提供用紙 ・オーダーシート お見積時にこれらのファイルをメール添付でお送りしますので、 ご記入の上、サンプル送付時に送信ください。
データ解析（オプション）	アセンブル・マッピング 100,000円（税別） ※8サンプルまでの固定価格/9サンプル以降は追加料金12,500円/1サンプル 納期：＋2週間
	アセンブル・マッピング・遺伝子予測・機能解析 200,000円（税別） ※8サンプルまでの固定価格/9サンプル以降は追加料金25,000円/1サンプル 納期：＋4週間

データ解析（オプション）の説明

生リードから低品質塩基の除去を行った後、アセンブルを行い、コンティグ(配列断片)を取得します。得られた配列断片に対し、高品質のリードをマッピングし、各配列断片とマップされたリード数の対応表を作成します。

さらに遺伝子予測・機能解析では、配列断片から細菌の遺伝子を予測します。その後、予測された遺伝子配列はKEGGデータベースの配列と比較し、機能的な注釈を付加します。

〔アセンブル・マッピング・遺伝子予測・機能解析〕納品データのサンプル

2.DNBSEQについてよくある質問

Q1.特徴は？

なんといってもコストパフォーマンスがよいことです。低価格で高品質のショートリードが取得できます。

Q2.出力データはどんな形式？

出力はfastqファイルで、Q値は最新のイルミナ社製シーケンサーと同様にsanger形式です。

Q3.生データのクオリティは？

DNBSEQ-G400(MGI社）とHiSeq（イルミナ社）を用いてシーケンシング解析を行い、取得したリードのQ20およびQ30を比較したところ、2機種のそれらは同等でした。

 

3.ちらしPDF

　DNBSEQを用いたメタトランスクリプトーム解析のパンフレットPDF

4. お問合せ・サンプル送付先

お問合せ・お見積り依頼

お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または　お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。

サンプル送付先

移転のため、送付先が変更になりました。ご注意ください。
株式会社生物技研
〒252-0154　神奈川県相模原市緑区長竹657　/　TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。
＜添付書類＞
・サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください。
・オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください