非モデル生物のRNA-seqについて

非モデル生物のRNA-seqについて

参照ゲノム配列の情報がない生物(非モデル生物)でもRNA-seqのデータを利用することで参照配列を得ることができます。

RNAseq用ライブラリーを150bpペアエンドリードで解析します。
得られたリードをデノボアセンブルすることで発現遺伝子カタログを作成し、参照ゲノムの代わりとしてマッピングに使います。

RNA-seqデータを利用した発現遺伝子カタログの作成
(発現比較解析用参照配列の作成)

価格 150,000円
<内訳>
DNBSEQ-G400 150bpペアエンド解析(3,000万リード保証) 50,000円
De novo transcriptome assembly※1      100,000円
納期 4~6週間

※1 アノテーションは付加されません。付加する場合は、別途追加料金が必要になります(こちらのページをご覧ください)。

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