ATAC-seq解析

★2026年9月 サンプル受入れ開始★
ACTIVE MOTIF ATAC-Seq Express Kitを用いた
ATAC-seq解析

1.サービス概要

価格(税別) 180,000円/サンプル
ご提供サンプル 凍結細胞
・予備含め3チューブご準備ください。
・生細胞のみの受付となります。
細胞の固定は行わないでください。
・初代培養細胞の場合は、30~40 μmストレイナーによるフィルター処理をしてください。
・凍結はセルバンカーやFBS+DMSO溶液などを使用し、- 80℃以下で保管してください。
<サンプル条件>
・細胞数:4x 10^5 細胞以上/チューブ
・生存率:凍結融解後 80%以上
(凍結前に生存率90%以上推奨)
新鮮凍結組織
・予備含め3チューブご準備ください。
・採取後ただちに液体窒素等で凍結させてください。
<サンプル条件>
・組織量:20~30 mg/チューブ
作業内容 ・凍結細胞の生存率を確認(生存率80%以上で合格。生存率80%未満の場合は解析の進め方について要相談)
・ライブラリー作製
・シーケンシング解析(DNBSEQ-T7)
・データ解析
・核単離
・顕微鏡観察による単離核の確認(異常ありの場合は解析の進め方について要相談)
・ライブラリー作製
・シーケンシング解析(DNBSEQ-T7)
・データ解析
対象生物 動物
納期 25営業日
※データ解析不要(生データ納品)の場合は20営業日
※12サンプルまでの納期。それを超える場合は5営業日/12サンプル追加
データ量 3,000万ペアリード (9 Gb)
納品物 ・報告書
・シーケンス生データ(fastq形式)
・マッピング結果(bam形式、bw形式)
・ピークコール結果
・ピーク近傍遺伝子のアノテーション結果
・カウントと比較結果
・Motif解析結果
・参照配列(fasta形式)と遺伝子アノテーション(gtf形式)
・DDBJのデータベース登録に必要なデータ
※比較解析とMotif解析は2群以上、複数反復サンプルのみ追加実施
ご依頼の流れ まずは、お見積りをご依頼ください。お見積り依頼フォームをご用意しています。

2.ATAC-seq解析の具体例

マウス脳・肝臓組織における各マーカー遺伝子ゲノム領域のマッピング結果
デモデータ(約900 MB)
ATAC-seq解析の具体例

3.よくある質問

準備中

4.ちらしPDF

ATACseq解析ちらし ATAC-seq解析のパンフレットPDF

5.お問合せ・サンプル送付先

●お見積り依頼

お見積りフォームがございます。
・ATAC-seq解析お見積りフォーム

●お問合せ

お問合せフォーム、メール(dna@gikenbio.com)、または お電話(042-780-8333)でお気軽にご相談ください。

●サンプル送付先

株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657
TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

 

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