マイクロバイオームとは地球上の様々な場所(動植物、土壌、海洋、大気、生活空間等)に存在している膨大な種類・量の微生物の集団のことです。場所が変わればマイクロバイオームも変わります。
微生物=細菌、真菌、ウイルスなど
マイクロバイオーム(微生物叢)=微生物の集団
ヒトの消化管(いわゆる腸内細菌)や口腔内、皮膚などの部位にそれぞれ特有のマイクロバイオームが存在します。腸内細菌は、特に研究されており、約1,000種類/約100兆個、約1-1.5kg分存在すると言われ、ヒトへの栄養供給、免疫系や代謝系の調節など、体内で様々な役割を担っていることが明らかになりつつあります。