ゲノム解析

ゲノム解析

ドラフトゲノム解析 (1)バクテリアとアーキア

価格と納期 <NextSeq 150bpペアエンド解析の場合>
100,000円(税別)
納期:4~6週間
<MiSeq 300bpペアエンド解析の場合>
200,000円(税別)
納期:4週間
※いずれも3サンプル以上で数量割引有
ご提供
サンプル
抽出ゲノムDNA(>50ng/ul、>20ul)
ご提出書類 1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください
2.オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
作業内容 ・シーケンスライブラリー作製
・シーケンス解析
・リードのアセンブル
・ソフトウェアによるオートアノテーション
prokka(ソフトウェア)を使用して得られた予測遺伝子配列とタンパク質配列、遺伝子の位置情報(gff形式データ)をご提供します。
オプション ◆DNA抽出
試料を送付いただき、弊社でDNA抽出を行うことも可能です。
価格: +10,000円/サンプル(税別)
納期: +1週間

◆マニュアルアノテーション
オートアノテーションから得られた予測遺伝子をKEGGやGOデータベースに登録されている配列と比較することで、得られた予測遺伝子にKEGG_IDやGO_IDを対応させます。
価格: +100,000円(税別)
納期: +1週間

◆ナノポア社のGridION X5 を使用したシーケンス解析
ロングリードが得られますので、contigを一本にすることが可能になります。
価格:+100,000円(税別)
納期:追加日数なし

 

ドラフトゲノム解析 (2)真核生物(注1)

ゲノムサイズ100Mb未満 ゲノムサイズ1Gb未満 ゲノムサイズ1Gb以上(注2)
価格 100,000円(税別) 200,000円~(税別) お見積りいたします
納期 2~3ヶ月
ご提供
サンプル
抽出ゲノムDNA(>50ng/ul、>20ul)
ご提出書類 1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください
2.オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
作業内容 ・シーケンスライブラリー作製
・シーケンス解析(イルミナ社のNextSeqまたはHiSeqを用いた150bpペアエンド解析)
取得データ量はゲノムサイズの50倍以上
オプション ◆DNA抽出
価格: +10,000円/サンプル
納期: +1週間

◆データのアセンブル
価格:+50,000円(ゲノムサイズ100Mb未満)、+100,000円(ゲノムサイズ1Gb未満)
納期:+10営業日(ゲノムサイズ100Mb未満)、+15営業日(ゲノムサイズ1Gb未満)
※ゲノムサイズ1Gb以上の場合は、都度お見積りいたします。

◆Exonerateを用いたEvidence-baseの遺伝子予測
価格:+50,000円
※遺伝子モデルに使用する遺伝子配列を送付いただく必要がございます。

◆RNA-seqを用いた遺伝子予測
価格:+100,000円
納期:+1週間
※サンプル送付時にトータルRNAも送付いただく必要がございます。

◆ナノポア社のGridION X5 を使用したシーケンス解析
価格:+150,000円~ ※ゲノムサイズによる
納期:+1週間

注1)ヘテロ接合度の多い生物種や倍数性の生物種の場合、お断りさせていただく場合があります(お見積り作成の段階やアセンブルの前処理時に判断させていただきます)。
注2)ゲノムサイズやゲノムの構造によって価格と納期が決まります。

 

リシーケンス解析

価格 お見積りいたします
<参考価格>
◆ゲノムサイズ5Mbのバクテリア10株のリシーケンス解析の場合  (税別)
・ライブラリー作製    20,000円×10=200,000円
・シーケンシング解析 (3Gb) 140,000円
・マッピングとORFの変異点解析 100,000円+20,000円×5=200,000円(注3)
納期 4週間
ご提供
サンプル
抽出ゲノムDNA(>50ng/ul、>20ul)
ご提出書類 1.サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください
2.
オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
作業内容 ・リシーケンスライブラリー作製
・NextSeq500を用いた75bpシングルリード解析
・参照ゲノムへのマッピング
・SNPの検出
・ORFの変異点解析(注4)

(注3)5株以下は一律10万円となり、6株以上の場合は1株につき2万円追加料金となります。
(注4)参照配列に遺伝子アノテーションがない場合は、ORFの変異点解析はできません。

 

ゲノム解析リシーケンス解析ちらし ゲノム解析・リシーケンス解析のパンフレットPDF

 

●お問合せ・お見積り依頼

お問合せフォーム、メール(dna@gikenbio.com)、または お電話(042-780-8333)でお気軽にご相談ください。

●サンプル送付先

移転のため、送付先が変更になりました。ご注意ください。
株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

<添付書類>
サンプル情報提供用紙→サンプル送付時に同封ください。
オーダーシート→dna@gikenbio.comへ送信ください
データ解析依頼書→dna@gikenbio.comへ送信ください

次世代シーケンス解析

生物種の同定

次世代シーケンスデータのDDBJへの登録について 遺伝子解析サービスについて

なんでもかんでもアンプリコンシーケンス

  1. 味噌
  2. キムチ
  3. お米のRAD-seq解析

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