2023年10月サービス開始！
PacBio Revio / Sequel lle ならバイサルファイト処理なしで、キネティクス情報を含むデータを得ることが可能です。
弊社のメチル化解析では、原核生物は4mCと6mA、真核生物は5mCを対象として解析を実施します。
1.メチル化解析（ロングリード・PacBio Revio / Sequel lle）サービス概要
| 解析対象 | ゲノムサイズ※1 | サンプル数 | 単価（税別） | 納期 | 納品形態 |
|---|---|---|---|---|---|
| 原核生物 | 4 Mb以下 | 1~3 | 140,000円/サンプル | 40営業日 | ダウンロード |
| 4～5 | 130,000円/サンプル | 40営業日 | |||
| 6～7 | 130,000円/サンプル | 41営業日～ （35営業日＋1営業日×サンプル数） |
|||
| 8～ | 120,000円/サンプル | ||||
| 20 Mb以下 | 170,000円/サンプル | ５サンプルまで40営業日 ５サンプル以上35営業日＋1営業日×サンプル数 |
記録媒体 | ||
| 真核生物 | 50 Mb以下 | 170,000円/サンプル | 35営業日＋5営業日×サンプル数 | 記録媒体 | |
| 100 Mb以下 | 245,000円/サンプル | ||||
| 300 Mb以下 | 395,000円/サンプル | ||||
| 1 Gb以下 | 545,000円/サンプル | ||||
| 1セル占有 | 2.5 Gb程度以下※2 | 820,000円/セル・サンプル | ２セルまで35営業日＋5営業日×サンプル数 | 記録媒体 | |
※1 ご依頼時にゲノムサイズをお知らせください。原核生物はゲノムサイズの50倍、真核生物はゲノムサイズの20倍のデータを取得します。
※2 １セル占有の取得データ量は50 Gb程度です。サンプルに依存するため、データ量の保証はできません。また、ゲノムサイズ2.5 Gb超の生物を解析する場合は、ゲノムサイズに応じて複数セルでのシーケンシング解析が必要になります。
| 作業内容 | ・送付サンプルのDNA濃度測定（蛍光法による2本鎖DNAの定量・吸光度によるDNAの定量・電気泳動） ・シーケンスライブラリー作製（PCRフリーのライブラリー作製） ・シーケンシング解析（PacBio Revio または Sequel lleを用いてHiFiリードを取得） ・メチル化解析 <原核生物のメチル化解析内容> 4mCと6mAを対象として、塩基のメチル化の確率を計算し、メチル化モチーフを同定します。 ＜真核生物のメチル化解析内容＞ 参照配列にマッピング後、5mCを対象として、塩基のメチル化の確率を計算します（真核生物の場合、参照配列は必ず必要です）。 |
|---|---|
| 納品物 | 納品形態は上の表をご覧ください（ダウンロードまたは記録媒体での納品となります）。 ・報告書 ・シーケンス生データ（fastq形式） ・DDBJのデータベース登録に必要なデータ ・メチル化解析結果 【原核生物のメチル化解析】納品データのサンプル |
| ご提供 サンプル |
1.DNA量 濃度50 ng/ul以上、総量 4 ug以上 ※メチル化解析の場合は、PCRをしないライブラリー調製のため、上記の通りDNAが多く必要です。 ※複数セル占有でご依頼の場合は、1セルごとに上記のDNAが必要です。 2.DNAの品質 3.バッファー 4.送付方法 |
| ご依頼の流れ | まずはお見積りをご依頼ください。お見積り依頼フォームをご用意しています。 |
2.オプション
| 項目 | 備考 | 価格（税別） | 追加納期 |
|---|---|---|---|
| DNA抽出（ロングリード用） | Genomic-tip（QIAGEN）等の長鎖DNA用抽出キットを用いて、DNA抽出を行います。 <サンプル量の目安と送付方法> ●菌体の場合 ご提供いただくサンプル量の目安は、細胞数 5×10^9以上、湿重量 100 mg以上です。ただし、菌種によってはDNA抽出効率が悪いものもありますので、多めに送付していただくのがよいです。 また、死菌が増えてくるとDNAが断片化されてしまいますので、死菌の少ない対数増殖期に集菌をお願いします。 菌体ペレットを-80℃保管→冷凍便でお送りください。 ●菌体以外の場合 菌体と同様、多めにご送付ください。 採取後速やかに-80℃保管→冷凍便でお送り下さい。 |
30,000円/サンプル | 5営業日 |
3.お問合せ・サンプル送付先
●お見積り依頼
お見積りフォームがございます。
・メチル化解析お見積りフォーム
●お問合せ
お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。
●サンプル送付先
株式会社生物技研
〒252-0154 神奈川県相模原市緑区長竹657 / TEL 042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。
＜添付書類＞
・依頼書→dna@gikenbio.comへ送信ください
