1.ヒト エキソーム解析/全ゲノム解析　サービス概要

		ヒト エキソーム解析	ヒト全ゲノム解析
価格 （税別）	ライブラリー調製～ シーケンシング解析	100,000円/サンプル	200,000円/サンプル
	標準データ解析 （参照配列へのマッピング、SNV/InDel）	1-2サンプル：25,000円/サンプル 3-4サンプル：23,000円/サンプル 5-7サンプル：20,000円/サンプル 8サンプル-：17,000円/サンプル	1-2サンプル：50,000円/サンプル 3-4サンプル：48,000円/サンプル 5-7サンプル：46,000円/サンプル 8サンプル-：44,000円/サンプル
	オプションデータ解析（SV 解析）	※5サンプル以上のみ対応 5-7サンプル：16,000円/サンプル 8サンプル-：14,000円/サンプル	1-2サンプル：20,000円/サンプル 3-4サンプル：18,000円/サンプル 5-7サンプル：16,000円/サンプル 8サンプル-：14,000円/サンプル
	納品用HDD	10,000円 （弊社でご用意する場合。お手持ちのHDDを送付いただく場合は費用はかかりません）	10,000円 （弊社でご用意する場合。お手持ちのHDDを送付いただく場合は費用はかかりません）
データ量		10Gb	1レーン占有（75-80Gb程度）
納期		6週間 ※10サンプルまでの納期。10サンプル以上は要相談。 ※シーケンシング解析までのみをご希望の場合は、20営業日	8週間 ※10サンプルまでの納期。10サンプル以上は要相談。 ※シーケンシング解析までのみをご希望の場合は、20営業日
作業内容		・送付サンプルのDNA濃度測定（蛍光法による2本鎖DNAの定量） ・シーケンスライブラリー作製 ・シーケンシング解析（DNBSEQ 150bpペアエンド解析）
		・標準データ解析 1.FastQCで塩基の品質を確認します。 2.BWAで Human Reference Genomeに対しマッピングを行い、samファイルを生成します。※Human Reference Genomeは、hg19 または hg38 のどちらかをご指定ください。 3.Samtoolsでbam形式へ変換します。※cram形式も可能です。 4.GATKパイプラインでduplicatesリードを除いた後、配列品質を再評価して、vcfを生成します。 5.得られた変異にアノテーション情報を付加します。
		・オプションデータ解析 1.Speedseqでマッピングを行い、bamファイルを生成します。 2.manta（エキソーム解析）またはlumpy（全ゲノム解析）で構造変異をコールします。 ※ご希望のソフトやツールがある場合は、ご相談ください。
納品物		以下のデータをHDDに保存して納品します。 ・作業報告書 ・シーケンシング生データ（fastq形式） ・マッピングデータ（bam形式）※cram形式も可能です ・変異検出結果（vcf形式） ・変異のアノテーション情報を付加したデータ（エクセル形式） ＜オプション解析ご依頼の場合＞ ・構造変異検出結果（vcf形式）
ご提供サンプル		抽出ゲノムDNA（＞10 ng/ul、＞20 ul） ※濃度は、蛍光法を用いた2本鎖DNAの定量結果を基準としています。
		● 260 nmの吸光度ベースで定量されている場合 上記より高めの濃度（可能であれば、 >100 ng/ul）で送っていただく必要があります。DNAの質は一般的な260/280が1.8以上が望ましいです。
ご依頼の流れ		まずはお見積りをご依頼ください。お問合せフォームから、解析内容（エキソーム or 全ゲノム）・サンプル数・オプション解析内容についてお知らせください。

 

2.オプション

項目	備考	価格（税別）	追加納期
DNA抽出	試料を送付いただき、弊社でDNA抽出を行います。	10,000円/サンプル	1週間

3.ちらしPDF

ヒト エキソーム解析/全ゲノム解析のパンフレットPDF

4.お問合せ・サンプル送付先

お見積り・お問合せ

お問合せフォーム、メール（dna@gikenbio.com）、または　お電話（042-780-8333）でお気軽にご相談ください。

サンプル送付先

株式会社生物技研
〒252-0154　神奈川県相模原市緑区長竹657　/　TEL　042-780-8333
※平日着でお送りください。発送は元払いでお願いしています。

＜添付書類＞
・依頼書→dna@gikenbio.comへ送信ください