Diamondを使用した配列相同性解析の特徴
弊社はタンパク質用の配列相同性検索を行う際に、BLASTX/BLASTPと同等の機能を持つツールDiamondを選択できます。Diamondは高い検索精度を維持しつつ、BLASTより高速化を実現しています(論文)。
対応できる解析内容：
クエリ配列：塩基配列やアミノ酸配列
データベース配列：アミノ酸配列
※Diamondは、塩基配列のデータベースには対応しておりません
遺伝子解析サービス
- アンプリコンシーケンス解析（ショートリード・illumina）
- ロングアンプリコン解析（PacBio Revio / Sequel）
- 環境DNAの解析
- 野生生物の食性解析
- ゲノム解析・ショットガンメタゲノム解析（ショートリード・MGI DNBSEQ）
- ゲノム解析・ショットガンメタゲノム解析（ロングリード・PacBio Revio/Sequel）
- メチル化解析（ロングリード・PacBio）
- メタトランスクリプトーム解析
- RNA-seq解析（遺伝子発現解析）
- ┣miRNA-seq解析サービス
- Iso-seq解析（ロングリードRNA-seq解析・PacBio社）
- GRAS-Di®解析・MIGseq解析・RADseq解析
- マーカー開発支援サービス
- 生物種の同定
- アノテーション（機能注釈）付け
新しい試み
